Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FRMPD1Q5SYB0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms