Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms