Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
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UBE4AQ14139 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
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