Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SHROOM2Q13796 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
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