Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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