Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms