Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD3P84022 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms