Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPFP49454 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPFP49454 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPFP49454 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPFP49454 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPFP49454 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPFP49454 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPFP49454 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPFP49454 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPFP49454 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPFP49454 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPFP49454 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPFP49454 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPFP49454 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPFP49454 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPFP49454 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPFP49454 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPFP49454 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPFP49454 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPFP49454 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPFP49454 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPFP49454 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPFP49454 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPFP49454 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPFP49454 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPFP49454 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPFP49454 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPFP49454 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPFP49454 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPFP49454 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPFP49454 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPFP49454 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPFP49454 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPFP49454 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPFP49454 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPFP49454 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPFP49454 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPFP49454 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
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CENPFP49454 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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CENPFP49454 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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CENPFP49454 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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CENPFP49454 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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CENPFP49454 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPFP49454 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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CENPFP49454 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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CENPFP49454 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPFP49454 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPFP49454 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPFP49454 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPFP49454 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPFP49454 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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CENPFP49454 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPFP49454 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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CENPFP49454 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPFP49454 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPFP49454 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPFP49454 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPFP49454 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPFP49454 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPFP49454 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPFP49454 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPFP49454 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPFP49454 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPFP49454 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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