Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
NESP48681 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NESP48681 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NESP48681 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NESP48681 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NESP48681 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NESP48681 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NESP48681 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NESP48681 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NESP48681 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NESP48681 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NESP48681 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NESP48681 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
NESP48681 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
NESP48681 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
NESP48681 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NESP48681 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NESP48681 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NESP48681 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NESP48681 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NESP48681 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NESP48681 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NESP48681 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NESP48681 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NESP48681 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NESP48681 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NESP48681 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NESP48681 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NESP48681 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NESP48681 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NESP48681 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NESP48681 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NESP48681 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NESP48681 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NESP48681 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
NESP48681 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NESP48681 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NESP48681 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NESP48681 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NESP48681 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
NESP48681 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NESP48681 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NESP48681 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NESP48681 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NESP48681 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NESP48681 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NESP48681 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NESP48681 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NESP48681 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NESP48681 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NESP48681 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NESP48681 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NESP48681 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NESP48681 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NESP48681 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NESP48681 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NESP48681 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NESP48681 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NESP48681 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NESP48681 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
NESP48681 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NESP48681 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NESP48681 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NESP48681 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NESP48681 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
NESP48681 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NESP48681 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
NESP48681 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NESP48681 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NESP48681 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
NESP48681 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NESP48681 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NESP48681 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NESP48681 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
NESP48681 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NESP48681 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NESP48681 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NESP48681 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NESP48681 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NESP48681 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NESP48681 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NESP48681 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
NESP48681 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
NESP48681 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NESP48681 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NESP48681 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NESP48681 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
NESP48681 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NESP48681 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NESP48681 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NESP48681 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NESP48681 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NESP48681 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NESP48681 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NESP48681 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NESP48681 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NESP48681 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NESP48681 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NESP48681 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NESP48681 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms