Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms