Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms