Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Y9

H2AFB1, Histone H2A-Bbd type 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFB1P0C5Y9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms