Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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