Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP19O94966 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP19O94966 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP19O94966 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP19O94966 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP19O94966 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
USP19O94966 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
USP19O94966 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP19O94966 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP19O94966 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP19O94966 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP19O94966 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP19O94966 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP19O94966 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP19O94966 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP19O94966 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
USP19O94966 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP19O94966 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP19O94966 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
USP19O94966 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP19O94966 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP19O94966 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP19O94966 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP19O94966 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP19O94966 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP19O94966 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP19O94966 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP19O94966 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP19O94966 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP19O94966 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP19O94966 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP19O94966 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP19O94966 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP19O94966 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP19O94966 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP19O94966 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP19O94966 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP19O94966 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP19O94966 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP19O94966 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP19O94966 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP19O94966 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP19O94966 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP19O94966 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP19O94966 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP19O94966 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP19O94966 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP19O94966 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP19O94966 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP19O94966 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP19O94966 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP19O94966 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP19O94966 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP19O94966 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP19O94966 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP19O94966 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP19O94966 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP19O94966 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP19O94966 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
USP19O94966 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP19O94966 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP19O94966 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP19O94966 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP19O94966 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP19O94966 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP19O94966 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP19O94966 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP19O94966 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
USP19O94966 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP19O94966 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP19O94966 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP19O94966 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP19O94966 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms