Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms