Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP9BO43861 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP9BO43861 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP9BO43861 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP9BO43861 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP9BO43861 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP9BO43861 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP9BO43861 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP9BO43861 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP9BO43861 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP9BO43861 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP9BO43861 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP9BO43861 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP9BO43861 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP9BO43861 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP9BO43861 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP9BO43861 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP9BO43861 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP9BO43861 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP9BO43861 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP9BO43861 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP9BO43861 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP9BO43861 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP9BO43861 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP9BO43861 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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