Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.6 ms