Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GDAP2Q9NXN4 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms