Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms