Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
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