Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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ZBED3Q96IU2 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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ZBED3Q96IU2 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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ZBED3Q96IU2 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
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ZBED3Q96IU2 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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ZBED3Q96IU2 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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ZBED3Q96IU2 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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ZBED3Q96IU2 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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ZBED3Q96IU2 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
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ZBED3Q96IU2 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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ZBED3Q96IU2 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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ZBED3Q96IU2 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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ZBED3Q96IU2 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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ZBED3Q96IU2 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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