Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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GTF3C6Q969F1 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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GTF3C6Q969F1 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
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GTF3C6Q969F1 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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GTF3C6Q969F1 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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GTF3C6Q969F1 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF3C6Q969F1 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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GTF3C6Q969F1 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF3C6Q969F1 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF3C6Q969F1 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF3C6Q969F1 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF3C6Q969F1 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF3C6Q969F1 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF3C6Q969F1 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF3C6Q969F1 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF3C6Q969F1 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF3C6Q969F1 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF3C6Q969F1 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF3C6Q969F1 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF3C6Q969F1 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF3C6Q969F1 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF3C6Q969F1 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF3C6Q969F1 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF3C6Q969F1 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF3C6Q969F1 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF3C6Q969F1 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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