Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CLPPQ16740 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
CLPPQ16740 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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