Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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