Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.9 ms