Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCINQ13939 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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CCINQ13939 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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CCINQ13939 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCINQ13939 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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