Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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SHROOM2Q13796 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
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SHROOM2Q13796 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
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SHROOM2Q13796 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
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SHROOM2Q13796 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC1.1□□□□□ -2.23
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SHROOM2Q13796 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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SHROOM2Q13796 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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SHROOM2Q13796 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHROOM2Q13796 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHROOM2Q13796 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SHROOM2Q13796 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SHROOM2Q13796 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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SHROOM2Q13796 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SHROOM2Q13796 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
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SHROOM2Q13796 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
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SHROOM2Q13796 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHROOM2Q13796 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SHROOM2Q13796 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHROOM2Q13796 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SHROOM2Q13796 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHROOM2Q13796 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHROOM2Q13796 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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SHROOM2Q13796 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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SHROOM2Q13796 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHROOM2Q13796 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SHROOM2Q13796 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SHROOM2Q13796 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHROOM2Q13796 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHROOM2Q13796 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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