Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBA3CQ13748 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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TUBA3CQ13748 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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TUBA3CQ13748 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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