Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
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