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| PTK7 | Q13308 | RNU2-25P-201 | ENST00000411041 | 191 nt | BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| PTK7 | Q13308 | SDAD1P3-201 | ENST00000427380 | 333 nt | BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
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| PTK7 | Q13308 | OR8J3-203 | ENST00000641913 | 3047 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| PTK7 | Q13308 | LIX1-201 | ENST00000274382 | 4026 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| PTK7 | Q13308 | MACF1-203 | ENST00000361689 | 17538 nt | TSL 5 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| PTK7 | Q13308 | RC3H1-201 | ENST00000258349 | 10988 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC004803.1-201 | ENST00000503602 | 3207 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
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| PTK7 | Q13308 | SNORA31.6-201 | ENST00000516241 | 130 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC007458.1-201 | ENST00000542812 | 373 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| PTK7 | Q13308 | IPO5P1-202 | ENST00000600039 | 287 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC073410.2-201 | ENST00000603240 | 332 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| PTK7 | Q13308 | YWHAEP7-201 | ENST00000617508 | 639 nt | TSL 3 BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| PTK7 | Q13308 | KIF21A-201 | ENST00000361418 | 5044 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| PTK7 | Q13308 | GABRA1-220 | ENST00000638159 | 4088 nt | TSL 5 BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| PTK7 | Q13308 | RBMS3-205 | ENST00000434693 | 8540 nt | TSL 5 BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| PTK7 | Q13308 | ANO3-204 | ENST00000531568 | 3117 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| PTK7 | Q13308 | PARP8-201 | ENST00000281631 | 7177 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| PTK7 | Q13308 | SYTL2-217 | ENST00000528231 | 3536 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTK7 | Q13308 | DLX6-AS1-201 | ENST00000430027 | 15364 nt | TSL 2 BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTK7 | Q13308 | LINC01247-201 | ENST00000448901 | 4209 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTK7 | Q13308 | NAIP-210 | ENST00000523981 | 4543 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTK7 | Q13308 | ZNF12-203 | ENST00000404360 | 4474 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTK7 | Q13308 | FLG-AS1-205 | ENST00000445097 | 2857 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNA5SP388-201 | ENST00000362584 | 119 nt | BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU4-9P-201 | ENST00000364951 | 139 nt | BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |