Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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ERCC8Q13216 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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ERCC8Q13216 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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ERCC8Q13216 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
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ERCC8Q13216 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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ERCC8Q13216 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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