Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.9 ms