Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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