Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms