Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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GTF3C1Q12789 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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GTF3C1Q12789 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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GTF3C1Q12789 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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GTF3C1Q12789 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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GTF3C1Q12789 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
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GTF3C1Q12789 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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