Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
RASGEF1BQ0VAM2 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RASGEF1BQ0VAM2 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RASGEF1BQ0VAM2 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RASGEF1BQ0VAM2 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RASGEF1BQ0VAM2 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RASGEF1BQ0VAM2 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RASGEF1BQ0VAM2 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RASGEF1BQ0VAM2 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RASGEF1BQ0VAM2 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RASGEF1BQ0VAM2 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RASGEF1BQ0VAM2 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RASGEF1BQ0VAM2 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RASGEF1BQ0VAM2 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RASGEF1BQ0VAM2 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RASGEF1BQ0VAM2 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RASGEF1BQ0VAM2 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RASGEF1BQ0VAM2 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms