Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ACADSBP45954 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ACADSBP45954 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ACADSBP45954 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ACADSBP45954 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ACADSBP45954 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ACADSBP45954 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ACADSBP45954 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ACADSBP45954 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ACADSBP45954 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ACADSBP45954 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ACADSBP45954 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ACADSBP45954 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ACADSBP45954 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ACADSBP45954 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ACADSBP45954 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ACADSBP45954 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ACADSBP45954 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ACADSBP45954 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms