Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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PTPRMP28827 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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PTPRMP28827 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
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PTPRMP28827 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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PTPRMP28827 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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PTPRMP28827 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
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PTPRMP28827 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
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PTPRMP28827 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
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PTPRMP28827 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
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PTPRMP28827 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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