Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1P23471 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms