Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRGP23470 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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