Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
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PTPRDP23468 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
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PTPRDP23468 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
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PTPRDP23468 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
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PTPRDP23468 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
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PTPRDP23468 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
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PTPRDP23468 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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PTPRDP23468 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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PTPRDP23468 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
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PTPRDP23468 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
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PTPRDP23468 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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PTPRDP23468 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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