Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms