Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
VPREB1P12018 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms