Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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