Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
AP5B1Q2VPB7 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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