Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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RTN1Q16799 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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RTN1Q16799 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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RTN1Q16799 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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RTN1Q16799 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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RTN1Q16799 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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RTN1Q16799 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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RTN1Q16799 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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RTN1Q16799 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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RTN1Q16799 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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RTN1Q16799 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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RTN1Q16799 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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RTN1Q16799 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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