Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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