Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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HIF1AQ16665 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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