Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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COL9A2Q14055 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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COL9A2Q14055 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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COL9A2Q14055 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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COL9A2Q14055 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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COL9A2Q14055 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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COL9A2Q14055 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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COL9A2Q14055 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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COL9A2Q14055 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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