Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCINQ13939 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCINQ13939 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCINQ13939 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCINQ13939 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCINQ13939 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCINQ13939 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCINQ13939 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCINQ13939 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCINQ13939 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCINQ13939 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCINQ13939 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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CCINQ13939 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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CCINQ13939 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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CCINQ13939 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCINQ13939 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCINQ13939 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCINQ13939 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCINQ13939 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCINQ13939 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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CCINQ13939 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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CCINQ13939 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCINQ13939 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCINQ13939 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCINQ13939 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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CCINQ13939 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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CCINQ13939 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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CCINQ13939 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCINQ13939 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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